第八十九章实验室见习积累的网络思考  学医路漫漫

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们做到的结果出了,只能说是万箭穿心。蛋白条带36和88kd的都没有出来,结果丑得一逼。亏我看师兄做实验的时候还自信自己可能会做地更好,现在想想,我哪里来的自信。我之前在学校做的实验成功率和结果都还不错,可是这与现在自己很多实验材料都要自己准备情况完全不一样。这可能与我们将来出社会的情况相似,一开始的心高气傲其实是一种虚幻的自信,只有经过现实的各种考验后才能认清楚真正的自己有几斤几两。

第九天:师兄首先总结qpcr的各种错误。首先是软件操作不熟练,有的设置错误,这是师兄请教师姐得出的结果。还有可能是操作的问题。而且还可能和师兄向师姐要的引物是不同种属的。这启示我们要材料时要注意来源,最好能够查查文献。-今天师兄给我们两篇文献来看(⊙o⊙)。感觉自己的档次好像不一样了。之前自己一个人胡乱找文章看总觉得有一层隔膜,好像总也看不进去,于是一股脑地看了很多篇,就当是积累了。我发现还是很有必要的,现在看不懂不要紧,看多了自然就会慢慢懂的。而经过在实验室的几天见习后,发现好像能够以更高的层次来理解一篇文章了。原本只能够理解其逻辑的连接,现在好像能够理解其底层的各种实验的意图了,比如说是通过对不同蛋白质的表达的量的变化,结合原有文献揭示的蛋白通路的关系,来验证甚至发现不同对象之间的联系。如已有通路abcd,如果经过一定的处理,如抑制b的表达,理论上可以发现c表达的下降,如果没有,说明还存在其他的调节机制,这就可以做下一步的研究了。-而且我之前一直很强调数据的美感,如的条带一定要均匀平直,现在我就没有那么高要求了,可能是因为自己亲自做过这些实验,知道出数据是多么不容易的一件事,也更加宽容了。

第十二天:qpcr的结果很奇怪,发现有某个基因表达显著明显下降,有100多倍,我当时就兴奋地不行不行的,这可能是比较有价值的发现,可能最后能够做到某种药物的靶点耶!结果师兄说这是在验证前人的发现,也就是做重复实验,而他们没有发现有这么高的变化,而且其他的相关基因的表达量变化不明显,可能是数据有问题。看来我还是一如既往地想多了,总想以为别人错了,但更大的可能是自己错了。但我还是不甘心,于是跑到谷歌学术去搜索文献,其中搜到一篇发现这个基因的表达是上升2倍。虽然说这是对人类细胞的测量,我们做的是小鼠细胞,但据师兄说其实表达也差不了多少,于是我们的rankl表达量明显下降100倍和已有的文献不符。在我们对这篇文献做出可信的假设的前提下,很大概率是我们出了问题。h-is-啊啊啊啊啊啊啊!当然,作为一个死理性派,我们还是可以考虑(妄想)存在低概率成立的可能,那就是这是一个前人没有做出的新发现/前人错了。但目前还是不要这么好高骛远比较好,对于我来说,万分之一的可能概率等于不存在。-实验出的结果总可能会出现部分问题,这就需要补做实验了,而实验材料不是说有就有的,培养需要时间。于是在做实验的同时要注意梯队的培养。这样每过几天就是一个周期,保持源源不断的供应。而且细胞的冻存也是很必要的。

第十三天:在准备做rt即逆转录的时候,师兄要保证rna的相对浓度一样,即不同浓度的rna加不同剂量。我们就使用计算机计算到零点零几微升,当然没有什么鬼用,我们还是要四舍五入到零点几微升,因为加样枪的精度有限。而且具体的生物学实验不需要那么高的精度。你不知道此刻的我是多么的庆幸!生物的各种过程的计算是比较模糊的,为生物对环境的适应度最大化提供保障,最终能够在一定的范围内形成一定的分布,而不是如同数学的各种计算可以精确到小数点后n位。虽然说多层次的分布的耦合可能导致存在一定的窗口期,也需要很精确的条件,但一般来说我们对变量的处理还是有一定概率出现结果,我们可以通过调节反应体系的不同变量的相对比例,如设置一定的梯度来确认最终的各变量的关系。也就是说,你可以有一定自由地折腾,因为最后的表达是如同马尔科夫序列表达的结果,可以理解为一定的分布,只要超过一定的阈值就可以有被观测到的效应。而这,是我们施加不同处理但有相同效果的原因,是不同路径的等价关系构建。

第十五天:看来我们要针对这个小课题做一次文献综述了。也就是说我需要在认为疾病是不同对象的竞争博弈形成均衡的前提下,选择已有的各种研究对象,如护骨素,来观测其对形成耦合对关系的基因之间的影响。我的理想是每一种运算对象对基因表达的影响是概率的,然后多个对象的共同作用可以如同贝叶斯公式一样把概率遍历起来。

第十九天:文献阅读后打算做的综述。-首先自然是大背景,骨质疏松对人群的危害等等之类的,然后就可以引几篇我没有认真看但很多人都要引的文献,如(nioeus,-2001).-(who,-press-release1999)之类的。然后就是吹牛对这个疾病的探究有多大的意义。areat-iial-and-econoodern-ular-eoporosis.只有疾病相关的研究才更能引起大家的兴趣。-然后就是比较具体的细节了。我打算以博弈论的观点来重新建构关于疾病的观点,即骨质疏


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