第八十九章实验室见习积累的网络思考  学医路漫漫

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的,我们的理想是能够统合大规模的数据,即对基本的序列关系的总结能够得出具体的通路,甚至是不动点式的本征通路。我们能够通过对这种通路的影响在宏观层次产生影响,即在基础研究与临床层次的研究构建起比较高的相关性。这种并非扯淡,参见已有的各种受体拮抗剂作为药物能够产生的作用对于医疗的促进。当然,这种不动点最辉煌的成就是抗生素对微生物的拮抗作用,如今的我们需要的是多层次耦合来逼近这种效果。其中对艾滋病的鸡尾酒疗法就是一次不错的尝试。

第四天:下午我们就正式做qpcr,就是各种加试剂,然后放到机器上。无话可说。等待的三个小时中我们跟师兄加了一下枪头,处理了一下细胞就可以休息了。我们回到休息室逮到师姐,缠着她问了一下实验背后的思路。答案是看文献,看人家的文章的逻辑推理和实验证明。当然我还是很贪心不足地想要在短短的见习期间对整体的课题研究有个大体的把握,于是搬出之前看的文献,问为什么这么优雅的逻辑可以通过这样一大堆丑恶的混乱的实验得到,结果发现是背后基于一大堆的前人工作所发现的通路,然后具体的课题是选择特定的对象来处理,然后有一定的变化可以揭示一定的关系,这就是文章中具有美感的re的小标题来。因此我认为没有美感的实验其实是我层次不够,只见树木不见森林。这再一次提醒我们背景的基础知识的重要性,我们只有建立一套共同的沟通语言才能进行有意义的交流。-至于课题的选择,那就需要导师的帮助和自己的努力才能确定方向,然后就是各种收集资料和阅读,在这个过程中不断地确定最终的想法。一句话,大量文献调研。再接下去的就是很细化的具体细节,不是小同行就很难交流下去了。-实验技术是术,各种理论是道,有道无术一无所成,有术无道不知所谓。我们需要术来验证我们的道,毕竟“大道易得,小术难求”,前者是网络这个宏观结构,后者是具体的网络路径的坍缩,是概率的涌现。

第五天:师兄和我们说了一些关于他的实验背后的原理,即我之前说过的森林,在一系列复杂实验背后的大图景。其实就是通过各种数据库的范围收缩,确定和自己目的相关的作用对象,在这里就是寻找和疾病相关的蛋白。通过蛋白芯片来筛选出表达变化较大的相关蛋白,然后选择其中的一些蛋白做各种实验如来验证其与疾病的各种层次的变化的相关性。师兄的目的是找到一个未被报道的蛋白,能够和宏观的疾病构建一定的相关性,从体外的细胞实验到体内的裸鼠的异种细胞移植再到临床样品的检测等等多层次来证明其相关性,从而最终为药物的靶点提供理论依据。这个过程就是对新知识的探索,谁也不知道会发生什么。这个过程的不断试错让我想起我们团建最后一课的一个游戏,就是在布满地雷的网格寻找一条安全的通路,这个过程需要失败很多次才能找到唯一确定的道路,这就对应于一定的蛋白通路的形成,即我们师兄想要弄的机制。可以预见,师兄将面临惨绝人寰的无数次的失败的折磨,才能找到最后的机制,发文章,成功毕业。一个重要的启示是脚踏实地,而我一直野心勃勃地想要来个大整合,结果浮在半空,这就很尴尬了。虽然说少年有梦想是好的,但成熟的人需要把目标分解为可以执行的小目标,才能最后整合完成最终的目的。我还需要继续学习。-继续做昨天失败了的qpcr。其中rna不稳定,于是反转录为dna,然后去做pcr可以大量扩增,我们就间接得到rna的信息。-在这个过程中,需要根据需要好好设计各种物质的量。今天打算做两组,使用不同的mix(试剂盒的一种试剂),结果发现好像转录的cdna不够了。然后引物好像也加错了。那就看看结果会怎样了。嗯,三个小时的等待的结果还是屎一样的数据。师兄明天继续努力,这也是一种不断排除错误的成长过程。

第六天:师兄给我们一次机会,完整地做一次。昨天配的胶今天发现不能用,只能再配一次。于是我们就等等等,毕竟真正的操作时间不长,等待的时间长,而且不同实验的间歇还需要做下一组实验的准备工作。-期间师兄带我们去看昨天的结果,结果惨不忍睹。实验不仅仅是一环接一环,连错误也是如此。一开始的胶配得不均匀,然后我们就在暗室看着跑出来的结果傻眼了。师兄只能再做一次,一次失败几天就白费了。-然后我们继续做。在加完样品跑电泳的时候已经差不多3点了,我们终于可以吃午饭了,外卖给我满汉全席的体验,实在是泪流满面。更令我泪流满面的是吃完饭跑去看看电泳做得怎么样了,结果发现条带成波浪形。实在见鬼了,我们配的胶不均匀,一开始的实验错了,我们接下来的实验就没有意义了。一步错步步错。

我们看着师兄做实验的时候,那叫一个舒爽,觉得都十分简单。没想到功夫在诗外啊!各种试剂的加样很简单,但怎样加,什么顺序什么浓度比例加就需要经验,而且为什么也有很大的讲究和学问。反正我们亲自动手时各种手忙脚乱,各种似是而非,有很多应该注意的地方没有注意到。到机器的各种参数的设置的时候,也是满实验室的跑来跑去找师兄师姐。可以说,现实给我这种梦想家一个狠狠的耳光。现实需要脚踏实地。我


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